中日医院呼吸学科是国内领衔学科，现为国家呼吸医学中心、国家呼吸临床研究中心、中国医学科学院呼吸病学研究院及世界卫生组织戒烟与呼吸疾病预防合作中心依托单位，也是国家呼吸疾病医疗质量控制中心、科技部呼吸与肺循环研究创新团队、呼吸学科是国家内科学（呼吸系病）重点学科主任与主要成员所在单位。

CR仪、一步法全自动医用PCR分析系统（Gene-Xpert）、BeckmanCoulter流式细胞仪（CytoFLEX LX）、微生物显微镜、脉冲场电泳系统、厌氧微需氧培养系统、超纯水器、全自动样品制备系统、基因芯片检测平台、二代测序仪、Nanopore四代测序仪等。目前，实验室建立多种方法的检测平台，开展125项检测项目，覆盖病毒、细菌、真菌、分枝杆菌、寄生虫及多种非典型病原体全面、准确、快速的病学学检测，极大地满足了临床诊疗的需求。

中日医院呼吸学科是国内领衔学科，现为国家呼吸医学中心、国家呼吸临床研究中心、中国医学科学院呼吸病学研究院及世界卫生组织戒烟与呼吸疾病预防合作中心依托单位，也是国家呼吸疾病医疗质量控制中心、科技部呼吸与肺循环研究创新团队、呼吸学科是国家内科学（呼吸系病）重点学科主任与主要成员所在单位。